地貌的改变、自然的灾害、人类无知的砍伐和破坏，民族与宗教间之争战等，都对世界遗产造成极大的威胁。人为的破坏如大型的建造工程、城市或旅游业的迅速发 展、土地使用不当等，都可能造成遗产地永久性的损毁甚至消失。为了积极保护这些珍贵的财富，世界遗产委员会特别设立了《濒危世界遗产名录》，凡遗产地受到 严重威胁，便可实时被列入名录之内。
对于被列入《濒危世界遗产名录》的项目，委员会需与有关会员国磋商，共同通过及展开一个救援方案，并持续监测项目的 进度，务求尽快恢复该地的原有价值及面貌，从名录中除名。目前名录中共有34处濒危的世界遗产，其中包括：耶路撒冷旧街区与城墙因民族纷争问题于1982 年被列入名录；印度马纳斯野生动物保护区因违法捕猎问题严重而于1992年被列入名录；也门宰比德历史古城因都市化及混拟土建筑物增加亦于2000年被列 入当中。
从以上例子，不难发现世界遗产时时刻刻总面临着许多无形的危机，幸而中国在有限的资源下仍作出种种努力，如在敦煌莫高窟植林以抵挡风沙侵害，对稀有动植物进行研究和立法保护等，务求使世界遗产不仅造福当代，更可流传后世。
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